POU5F1

POU class 5 homeobox 1

General Information

Name	POU class 5 homeobox 1
Alias	POU domain, class 5, transcription factor 1 POU domain transcription factor OCT4 POU-type homeodomain-containing DNA-binding protein octamer-binding protein 3 octamer-binding protein 4 octamer-binding transcription factor 3
Gene_family	POU class homeoboxes and pseudogenes
organism	Homo sapiens
entrez_id	5460
location	6p21.33
transcript_count	4
exon_count	6

Cross References

Location

by NCBI GRCh38.p14

Summary

Entrez This gene encodes a transcription factor containing a POU homeodomain that plays a key role in embryonic development and stem cell pluripotency. Aberrant expression of this gene in adult tissues is associated with tumorigenesis. This gene can participate in a translocation with the Ewing's sarcoma gene on chromosome 21, which also leads to tumor formation. Alternative splicing, as well as usage of alternative AUG and non-AUG translation initiation codons, results in multiple isoforms. One of the AUG start codons is polymorphic in human populations. Related pseudogenes have been identified on chromosomes 1, 3, 8, 10, and 12. [provided by RefSeq, Oct 2013]

Stringdb POU domain, class 5, transcription factor 1; Transcription factor that binds to the octamer motif (5'-ATTTGCAT-3'). Forms a trimeric complex with SOX2 on DNA and controls the expression of a number of genes involved in embryonic development such as YES1, FGF4, UTF1 and ZFP206. Critical for early embryogenesis and for embryonic stem cell pluripotency

nextProt Transcription factor that binds to the octamer motif (5'-ATTTGCAT-3'). Forms a trimeric complex with SOX2 or SOX15 on DNA and controls the expression of a number of genes involved in embryonic development such as YES1, FGF4, UTF1 and ZFP206. Critical for early embryogenesis and for embryonic stem cell pluripotency.

Interactions

NCBI

A	A.Source	B	B.DB	B.Source	Description
POU5F1	BioGRID	CTBP1	GeneID	BioGRID	Affinity Capture-MS
POU5F1	BioGRID	HNRNPM	GeneID	BioGRID	Co-localization
POU5F1	BioGRID	HMGB2	GeneID	BioGRID	Affinity Capture-Western
POU5F1	BioGRID	HMGB1	GeneID	BioGRID	Affinity Capture-RNA; Affinity Capture-Western
POU5F1	BioGRID	USP3	GeneID	BioGRID	Affinity Capture-Western
POU5F1	BioGRID	ATF4	GeneID	BioGRID	Affinity Capture-Western
POU5F1	BioGRID	ATF6	GeneID	BioGRID	Affinity Capture-Western
POU5F1	BioGRID	XBP1	GeneID	BioGRID	Affinity Capture-Western
POU5F1	BioGRID	POU3F3	GeneID	BioGRID	Affinity Capture-MS
POU5F1	BioGRID	STUB1	GeneID	BioGRID	Affinity Capture-MS; Affinity Capture-Western; Biochemical Activity
POU5F1	BioGRID	CTNNB1	GeneID	BioGRID	Affinity Capture-RNA; Affinity Capture-Western
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POU5F1	BioGRID	MYC	GeneID	BioGRID	Co-localization
POU5F1	BioGRID	CDKN1B	GeneID	BioGRID	Co-localization
POU5F1	BioGRID	SOX2	GeneID	BioGRID	Affinity Capture-MS; Affinity Capture-Western; Reconstituted Complex
POU5F1	BioGRID	BACH1	GeneID	BioGRID	Affinity Capture-Western
POU5F1	BioGRID	WWP2	GeneID	BioGRID	Affinity Capture-Western; Biochemical Activity; Reconstituted Complex
POU5F1	BioGRID	LRRK2	GeneID	BioGRID	Reconstituted Complex
POU5F1	BioGRID	CC2D2B	GeneID	BioGRID	Affinity Capture-MS
POU5F1	BioGRID	ITCH	GeneID	BioGRID	Affinity Capture-Western; Biochemical Activity
POU5F1	BioGRID	HMGA1	GeneID	BioGRID	Affinity Capture-MS
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POU5F1	BioGRID	PCGF1	GeneID	BioGRID	Affinity Capture-MS
POU5F1	BioGRID	CBX2	GeneID	BioGRID	Affinity Capture-MS
POU5F1	BioGRID	KDM2B	GeneID	BioGRID	Affinity Capture-MS
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POU5F1	BioGRID	PRAM1	GeneID	BioGRID	Affinity Capture-MS
POU5F1	BioGRID	TCF7L1	GeneID	BioGRID	Affinity Capture-MS
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POU5F1	BioGRID	C14orf93	GeneID	BioGRID	Affinity Capture-MS
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POU5F1	BioGRID	MRPS35	GeneID	BioGRID	Affinity Capture-MS
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POU5F1	BioGRID	CCAR2	GeneID	BioGRID	Affinity Capture-MS
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POU5F1	BioGRID	EP400	GeneID	BioGRID	Affinity Capture-MS
POU5F1	BioGRID	NSF	GeneID	BioGRID	Affinity Capture-MS
POU5F1	BioGRID	NDUFS3	GeneID	BioGRID	Affinity Capture-MS
POU5F1	BioGRID	NDUFS2	GeneID	BioGRID	Affinity Capture-MS
POU5F1	BioGRID	NDUFA5	GeneID	BioGRID	Affinity Capture-MS
POU5F1	BioGRID	NDUFA4	GeneID	BioGRID	Affinity Capture-MS
POU5F1	BioGRID	NBN	GeneID	BioGRID	Affinity Capture-MS
POU5F1	BioGRID	MRE11	GeneID	BioGRID	Affinity Capture-MS
POU5F1	BioGRID	TRPM1	GeneID	BioGRID	Affinity Capture-MS
POU5F1	BioGRID	MAX	GeneID	BioGRID	Affinity Capture-MS
POU5F1	BioGRID	DTYMK	GeneID	BioGRID	Affinity Capture-MS
POU5F1	BioGRID	ETS2	GeneID	BioGRID	Affinity Capture-Western; Reconstituted Complex
POU5F1	BioGRID	CETN2	GeneID	BioGRID	Affinity Capture-Western
POU5F1	BioGRID	FOXD3	GeneID	BioGRID	Affinity Capture-Western; Reconstituted Complex
POU5F1	BioGRID	PSMD10	GeneID	BioGRID	Affinity Capture-Western
POU5F1	BioGRID	NCL	GeneID	BioGRID	Affinity Capture-Luminescence; Affinity Capture-RNA
POU5F1	BioGRID	PURA	GeneID	BioGRID	Affinity Capture-RNA
POU5F1	BioGRID	PPIA	GeneID	BioGRID	Affinity Capture-RNA
POU5F1	BioGRID	YBX1	GeneID	BioGRID	Affinity Capture-RNA
POU5F1	BioGRID	KRT19	GeneID	BioGRID	Affinity Capture-RNA
POU5F1	BioGRID	KRT14	GeneID	BioGRID	Affinity Capture-RNA
POU5F1	BioGRID	KRT10	GeneID	BioGRID	Affinity Capture-RNA
POU5F1	BioGRID	KRT9	GeneID	BioGRID	Affinity Capture-RNA
POU5F1	BioGRID	KRT2	GeneID	BioGRID	Affinity Capture-RNA
POU5F1	BioGRID	KRT1	GeneID	BioGRID	Affinity Capture-RNA
POU5F1	BioGRID	HNRNPK	GeneID	BioGRID	Affinity Capture-RNA
POU5F1	BioGRID	H1-6	GeneID	BioGRID	Affinity Capture-RNA
POU5F1	BioGRID	GAPDH	GeneID	BioGRID	Affinity Capture-RNA
POU5F1	BioGRID	FKBP7	GeneID	BioGRID	Affinity Capture-RNA
POU5F1	BioGRID	EHMT2	GeneID	BioGRID	Affinity Capture-RNA
POU5F1	BioGRID	AGR2	GeneID	BioGRID	Affinity Capture-RNA
POU5F1	BioGRID	EIF5B	GeneID	BioGRID	Affinity Capture-RNA
POU5F1	BioGRID	NR2F2	GeneID	BioGRID	Affinity Capture-RNA
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POU5F1	BioGRID	SRSF3	GeneID	BioGRID	Affinity Capture-RNA
POU5F1	BioGRID	RPS25	GeneID	BioGRID	Affinity Capture-RNA
POU5F1	BioGRID	RPS23	GeneID	BioGRID	Affinity Capture-RNA
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POU5F1	TAF4	0	0	427	447	1	1
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POU5F1	HNF4A	0	0	743	755	1	1
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POU5F1	GATA5	0	0	229	301	1	1
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POU5F1	ZNF541	0	0	0	170	1	1
POU5F1	APOE	0	0	182	181	1	2
POU5F1	TNFSF11	0	0	141	156	1	2
POU5F1	ACTG2	0	0	125	178	1	1
POU5F1	CCT3	0	0	94	218	1	1
POU5F1	BGLAP	0	0	469	487	1	1
POU5F1	ITGA6	0	0	565	589	1	1
POU5F1	ACIN1	0	0	81	207	1	1
POU5F1	CRTC1	0	0	129	180	1	2
POU5F1	TFCP2	0	0	55	266	1	1
POU5F1	CDC42	0	0	202	203	1	2
POU5F1	PODXL	0	0	391	426	1	1
POU5F1	IRF8	0	0	108	309	1	1
POU5F1	DUX4L7	0	0	205	225	1	1
POU5F1	DKK1	0	0	463	496	1	1
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POU5F1	DKC1	0	0	447	469	1	1
POU5F1	TGFB1	0	0	251	386	1	2
POU5F1	GADD45G	385	0	184	481	1	1
POU5F1	KRT19	270	0	517	658	1	1
POU5F1	RAX	0	0	60	181	1	1
POU5F1	DDB1	270	0	116	388	1	1
POU5F1	STAT5B	0	0	202	219	1	1
POU5F1	TDRD12	0	0	124	212	1	1
POU5F1	ISX	0	0	57	177	1	1
POU5F1	ARID3B	0	0	460	853	1	1
POU5F1	SCGB1A1	0	0	166	180	1	1
POU5F1	KLF8	0	0	208	242	1	1
POU5F1	DDX20	270	0	46	285	1	1
POU5F1	ZNF384	0	0	61	173	1	1
POU5F1	CNN1	0	0	270	286	1	1
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POU5F1	USP7	270	0	150	361	1	1
POU5F1	LEUTX	0	0	171	262	1	1
POU5F1	NKX1-2	0	0	181	258	1	1
POU5F1	MRPS22	270	0	0	270	1	1
POU5F1	PRPF3	270	0	0	270	1	1
POU5F1	DCX	0	0	325	336	1	1
POU5F1	ARHGAP32	0	0	0	155	1	1
POU5F1	TUBB2A	0	0	97	153	1	1
POU5F1	MGST1	0	0	57	411	1	1
POU5F1	PEG3	0	0	264	280	1	2
POU5F1	FOXP3	0	0	228	261	1	2
POU5F1	HIST1H4D	0	0	324	409	1	1
POU5F1	METTL14	0	0	157	156	1	1
POU5F1	CLDN7	0	0	180	227	1	1
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POU5F1	CLDN4	0	0	141	181	1	1
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POU5F1	NCOA3	0	0	218	319	1	1
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POU5F1	BMP6	0	0	226	250	1	1
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POU5F1	GAP43	0	0	241	254	1	1
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POU5F1	ALPPL2	0	0	95	223	1	1
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POU5F1	DNTT	0	0	260	286	1	1
POU5F1	ARMCX1	270	0	50	276	1	1
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POU5F1	RERE	0	0	43	156	1	1
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POU5F1	FZD10	0	0	126	152	1	1
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POU5F1	WNT16	0	0	209	224	1	1
POU5F1	SIRT6	0	0	260	361	1	2
POU5F1	ANXA8	0	0	218	235	1	1
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POU5F1	SOX15	0	0	594	769	1	1
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POU5F1	SPARC	0	0	293	293	1	2
POU5F1	HNF1B	0	0	335	343	1	1
POU5F1	ROCK1	0	0	215	228	1	2
POU5F1	REC8	0	0	261	349	1	1
POU5F1	SERPINF1	0	0	124	160	1	1
POU5F1	GRHL3	0	0	162	281	1	1
POU5F1	PTBP2	0	0	155	287	1	1
POU5F1	BRWD1	0	0	0	173	1	1
POU5F1	CHD1	0	0	498	585	1	1
POU5F1	EP300	0	0	491	561	1	2
POU5F1	SIRPA	0	0	127	263	1	1
POU5F1	PDGFRB	0	0	391	404	1	2
POU5F1	TCF19	0	0	578	595	1	1
POU5F1	NUMB	0	0	323	358	1	1
POU5F1	LEF1	0	0	539	550	1	1
POU5F1	PKLR	0	0	147	325	1	1
POU5F1	CALU	0	0	0	184	1	1
POU5F1	C19orf53	270	0	0	270	1	1
POU5F1	IL4	0	0	170	169	1	1
POU5F1	WNT9B	0	0	205	220	1	1
POU5F1	DBT	0	0	0	173	1	2
POU5F1	DDC	0	0	150	180	1	1
POU5F1	ILF3	0	0	133	263	1	1
POU5F1	RFX4	0	0	160	202	1	1
POU5F1	ZMYM4	0	0	0	245	1	1
POU5F1	DUSP9	0	0	181	201	1	1
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POU5F1	HOPX	0	0	131	241	1	1
POU5F1	POLR2A	0	0	207	221	1	1
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POU5F1	APC	0	0	171	185	1	1
POU5F1	CREB1	0	0	310	441	1	2
POU5F1	USP9X	270	0	445	581	1	1
POU5F1	HAL	270	0	112	324	1	1
POU5F1	FGF14	0	0	48	194	1	1
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POU5F1	NFE2	0	0	166	165	1	1
POU5F1	CYP17A1	0	0	203	203	1	1
POU5F1	SDHB	0	0	268	268	1	1
POU5F1	BCL11B	0	0	264	296	1	1
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POU5F1	DGCR8	0	0	391	404	1	1
POU5F1	CREBBP	0	0	235	389	1	1
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POU5F1	ATP1A3	0	0	0	153	1	1
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POU5F1	TRIM71	0	0	227	397	1	1
POU5F1	ELAVL3	0	0	234	328	1	1
POU5F1	MAEL	0	0	251	268	1	1
POU5F1	BCL2L2-PABPN1	0	0	134	154	1	1
POU5F1	STAT1	0	0	289	288	1	2
POU5F1	HGFAC	0	0	142	173	1	1
POU5F1	OCLN	0	0	269	289	1	1
POU5F1	ALDH3B1	0	0	48	160	1	1
POU5F1	SMN1	0	0	183	210	1	1
POU5F1	ETS2	270	0	586	696	1	1
POU5F1	CXXC1	0	0	253	266	1	1
POU5F1	ACAN	0	0	358	372	1	1
POU5F1	NACA	0	0	0	173	1	1
POU5F1	UBN2	0	0	0	173	1	1
POU5F1	TCF20	270	0	75	309	1	1
POU5F1	NPAS2	0	0	0	158	1	1
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POU5F1	MOG	0	0	87	473	1	1
POU5F1	CTRL	0	0	227	240	1	2
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POU5F1	MTOR	0	0	391	407	1	2
POU5F1	LRRC40	0	0	0	173	1	1
POU5F1	LSM14B	270	0	0	291	1	1
POU5F1	JARID2	270	0	470	644	1	1
POU5F1	USP42	270	0	0	270	1	1
POU5F1	E2F2	0	0	209	209	1	1
POU5F1	SMOX	0	0	0	179	1	1
POU5F1	CXCR4	0	0	603	634	1	2
POU5F1	HIST1H4F	0	0	465	533	1	1
POU5F1	CYR61	0	0	174	180	1	1
POU5F1	CDSN	0	0	228	685	1	1
POU5F1	KAT6B	0	0	181	214	1	1
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POU5F1	KLF17	0	0	329	376	1	1
POU5F1	MMP1	0	0	194	194	1	1
POU5F1	ORC1	0	0	82	155	1	1
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POU5F1	CACNA1C	0	0	205	211	1	1
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POU5F1	HRAS	0	0	455	464	1	2
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POU5F1	VENTX	0	0	217	223	1	1
POU5F1	APP	0	0	219	306	1	2
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POU5F1	CXCL8	0	0	335	335	1	2
POU5F1	KIAA1551	0	0	0	185	1	1
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POU5F1	SART3	0	0	204	204	1	1
POU5F1	DDX28	270	0	0	282	1	1
POU5F1	CD151	0	0	144	159	1	1
POU5F1	IL6R	0	0	167	167	1	1
POU5F1	GBX2	0	0	504	546	1	1
POU5F1	RPL30	270	0	73	294	1	1
POU5F1	FAM107B	0	0	167	167	1	1
POU5F1	PAX2	0	0	426	465	1	1
POU5F1	KLK3	0	0	193	207	1	1
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POU5F1	UNG	0	0	270	289	1	1
POU5F1	GAD2	0	0	155	190	1	1
POU5F1	TEAD1	0	0	244	261	1	1
POU5F1	PRDM9	0	0	204	283	1	1
POU5F1	HLA-A	0	0	151	150	1	1
POU5F1	HRG	270	0	0	270	1	1
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POU5F1	TRIM26	0	0	166	607	1	1
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POU5F1	HOXC11	0	0	112	201	1	1
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POU5F1	CHD2	0	0	0	162	1	1
POU5F1	TACSTD2	0	0	140	206	1	1
POU5F1	RARB	0	0	166	234	1	1
POU5F1	HIST1H3B	0	0	95	187	1	1
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POU5F1	CCNA1	0	0	217	269	1	1
POU5F1	COMMD3-BMI1	0	0	719	770	1	1
POU5F1	KIT	0	0	684	724	1	2
POU5F1	RTCB	270	0	0	270	1	1
POU5F1	ATP1A4	0	0	123	213	1	1
POU5F1	KAT5	0	0	401	431	1	1
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POU5F1	HOXD11	0	0	181	204	1	1
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POU5F1	CHL1	0	0	247	246	1	1
POU5F1	MTA2	0	0	123	737	1	1
POU5F1	SLC2A14	0	0	218	257	1	1
POU5F1	FOXL1	0	0	123	289	1	1
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POU5F1	MAGEA4	0	0	341	356	1	1
POU5F1	ZNF76	0	0	0	221	1	1
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POU5F1	BHLHE41	0	0	90	170	1	1
POU5F1	NUDT1	0	0	152	151	1	1
POU5F1	GAPDHS	0	0	0	189	1	1
POU5F1	DNAAF2	270	0	0	270	1	1
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POU5F1	SUV39H1	0	0	391	428	1	1
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POU5F1	SETD1A	0	0	315	328	1	1
POU5F1	CEBPA	0	0	541	552	1	1
POU5F1	WRN	0	0	128	164	1	1
POU5F1	PATZ1	270	0	270	456	1	1
POU5F1	NEUROD1	0	0	543	575	1	1
POU5F1	ALX4	0	0	64	183	1	1
POU5F1	FXYD1	0	0	167	167	1	1
POU5F1	FBXW7	273	0	233	418	1	2
POU5F1	HPGDS	0	0	184	184	1	1
POU5F1	SP7	0	0	325	350	1	1
POU5F1	PAX8	0	0	336	357	1	1
POU5F1	SETDB1	270	0	957	986	1	1
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POU5F1	ZNF763	0	0	217	240	1	1
POU5F1	GLIS2	0	0	118	174	1	1
POU5F1	PLG	0	0	134	155	1	1
POU5F1	BMP7	0	0	370	400	1	1
POU5F1	HOXB2	0	0	218	232	1	1
POU5F1	PDPN	0	0	235	254	1	1
POU5F1	SCARA5	0	0	454	463	1	1
POU5F1	FGF17	0	0	141	390	1	1
POU5F1	KDM8	0	0	123	155	1	1
POU5F1	PPOX	270	0	0	270	1	1
POU5F1	CRX	0	0	250	304	1	1
POU5F1	GLI2	0	0	424	565	1	2
POU5F1	HIST1H4E	0	0	324	409	1	1
POU5F1	RRP12	270	0	0	270	1	1
POU5F1	KMT2B	0	0	317	330	1	1
POU5F1	CDK6	0	0	335	379	1	2
POU5F1	HDAC8	0	0	166	242	1	1
POU5F1	HOXD1	0	0	181	211	1	1
POU5F1	NEUROG3	0	0	560	596	1	1
POU5F1	NDUFA4	270	0	0	270	1	1
POU5F1	LRRC47	0	0	0	173	1	1
POU5F1	AMBP	0	0	119	187	1	1
POU5F1	CASQ2	0	0	155	161	1	1
POU5F1	TNFRSF10A	0	0	193	193	1	1
POU5F1	TUBB3	270	0	520	734	1	1
POU5F1	CNN2	0	0	0	197	1	1
POU5F1	CNTF	0	0	287	297	1	1
POU5F1	KIF4B	0	0	0	185	1	1
POU5F1	MLLT4	0	0	49	179	1	1
POU5F1	TICRR	0	0	0	213	1	1
POU5F1	SLC17A6	0	0	190	200	1	1
POU5F1	RFX6	0	0	210	251	1	1
POU5F1	LIG3	0	0	60	189	1	1
POU5F1	HIST2H3D	270	0	74	372	1	1
POU5F1	PRRC1	270	0	0	270	1	1
POU5F1	PBX2	0	0	75	220	1	1
POU5F1	HCFC1	0	0	180	672	1	1
POU5F1	CSNK2A2	0	0	123	215	1	1
POU5F1	MLLT10	0	0	66	194	1	1
POU5F1	NOTCH3	0	0	391	406	1	1
POU5F1	PGK1	0	0	281	294	1	2
POU5F1	KAT2A	0	0	252	269	1	1
POU5F1	HSPG2	0	0	103	243	1	1
POU5F1	ZNF436	0	0	218	235	1	1
POU5F1	ITGB1	0	0	635	671	1	1
POU5F1	PIWIL4	0	0	391	390	1	1
POU5F1	DSPP	0	0	263	269	1	1
POU5F1	NPAS1	0	0	0	164	1	1
POU5F1	BAG2	270	0	0	285	1	1
POU5F1	HESX1	0	0	297	407	1	1
POU5F1	LEPR	0	0	204	221	1	1
POU5F1	IRX1	0	0	141	183	1	1
POU5F1	VRTN	0	0	146	316	1	1
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GO:0005634	Cellular Component	nucleus	located_in	IC
GO:0005634	Cellular Component	nucleus	located_in	IDA

Pathways

Name	DB	ID
Developmental Biology	Reactome	R-HSA-1266738
POU5F1 (OCT4), SOX2, NANOG repress genes related to differentiation	Reactome	R-HSA-2892245
POU5F1 (OCT4), SOX2, NANOG activate genes related to proliferation	Reactome	R-HSA-2892247
Transcriptional regulation of pluripotent stem cells	Reactome	R-HSA-452723
Germ layer formation at gastrulation	Reactome	R-HSA-9754189
Gastrulation	Reactome	R-HSA-9758941
Pre-implantation embryo (WP3527)	WikiPathways	WP3527_r120810
Endoderm differentiation (WP2853)	WikiPathways	WP2853_r116557
Cardiac progenitor differentiation (WP2406)	WikiPathways	WP2406_r119249
Wnt signaling pathway and pluripotency (WP399)	WikiPathways	WP399_r119242
Mesodermal commitment pathway (WP2857)	WikiPathways	WP2857_r118395
Sudden infant death syndrome (SIDS) susceptibility pathways (WP706)	WikiPathways	WP706_r117178
Nuclear receptors meta-pathway (WP2882)	WikiPathways	WP2882_r120815
let-7 inhibition of ES cell reprogramming (WP3299)	WikiPathways	WP3299_r88676
Glucocorticoid receptor pathway (WP2880)	WikiPathways	WP2880_r117734

Transcripts

Accession	Version	MolecularType	Name	NCBI	Comments
NM_002701	6	mRNA	transcript variant 1	NC_000006	Reference
NM_001173531	3	mRNA	transcript variant 3	NC_000006	Reference
NM_203289	6	mRNA	transcript variant 2	NC_000006	Reference
NM_001285986	2	mRNA	transcript variant 4	NC_000006	Reference